忍者中，角色之间的属性和技能设置是相对平衡的，没有绝对的克制关系，永恒佐助作为火影忍者中的强大角色其实并没有被明确地设置有克制他的角色。但是，可以从他的属性和能力来考虑，他的瞳术和灵气能力强大，因此拥有高抗性和高回避性的角色可能对他造成一定的困扰。
而对于攻击能力较强的角色，需要在技能的使用上寻找突破口，例如诱导他浪费光环或者虚弱状态下进行攻击。
根据漫画《火影忍者》的设定，只有新月佐助的普通忍具有克制永恒佐助的能力。因为新月佐助拥有利用“月读”能力的《刀剑》忍具，可以削弱永恒万花筒写轮眼的力量。
而永恒佐助的弱点则是持续时间，瞳术只能维持一段时间，时间一过，永恒万花筒写轮眼的能力也会消失。因此，在对战永恒佐助时，利用新月佐助的忍具斩断其瞳术的持续时间是非常有效的策略。
