方舟灭绝中有四个boss，分别为巨型蜘蛛（Broodmother Lysrix）、巨鲸（Megapithecus）、巨龟（Dragon）、戈薇尔（Rockwell）。其中巨型蜘蛛是最易打的boss，巨鲸和巨龟难度逐渐递增，而戈薇尔则被认为是最难打的boss。每个boss都需要不同的策略和装备才能成功击败。参加boss战需要团队配合和游戏经验，比较需要花费较长的时间和耐心。
嗯有三个boss。都在洞口中，冰原洞口在雪山坐上角。沙漠洞口外正下方，在结界内，一个很大的金属悬崖，下面就是洞口。最后一个就在25，18.5，要注意的是这个位置是洞中洞。
